Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
THBS4P35443 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THBS4P35443 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms