Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms