Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKARP32238 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms