Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms