Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP1P29466 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP1P29466 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms