Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms