Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms