Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX2P28328 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX2P28328 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms