Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms