Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTX3P26022 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTX3P26022 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTX3P26022 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms