Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms