Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms