Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms