Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms