Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAV1P15498 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAV1P15498 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAV1P15498 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAV1P15498 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAV1P15498 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAV1P15498 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAV1P15498 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms