Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA1P15085 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms