Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms