Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms