Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHGAP10645 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHGAP10645 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHGAP10645 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHGAP10645 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms