Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIL1P09327 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIL1P09327 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIL1P09327 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIL1P09327 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIL1P09327 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIL1P09327 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms