Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP10P09238 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP10P09238 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP10P09238 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP10P09238 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP10P09238 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP10P09238 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP10P09238 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP10P09238 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP10P09238 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms