Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSLP07711 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSLP07711 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSLP07711 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSLP07711 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSLP07711 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSLP07711 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSLP07711 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms