Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms