Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DQB1P01920 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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