Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms