Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms