Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms