Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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