Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPAA1O43292 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms