Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD51BO15315 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms