Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms