Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E9PBE3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E9PBE3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E9PBE3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms