Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms