Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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