Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX2A2RU54 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms