Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ARL2-SNX15V9GYD0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ARL2-SNX15V9GYD0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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