Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms