Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms