Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP15Q9Y4E8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP15Q9Y4E8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms