Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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HCN4Q9Y3Q4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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HCN4Q9Y3Q4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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HCN4Q9Y3Q4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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HCN4Q9Y3Q4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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HCN4Q9Y3Q4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN4Q9Y3Q4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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