Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms