Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCQ9Y266 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms