Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms