Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS5Q9UPZ3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms