Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED23Q9ULK4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED23Q9ULK4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED23Q9ULK4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED23Q9ULK4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED23Q9ULK4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MED23Q9ULK4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms