Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms