Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO3Q9UK99 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms