Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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