Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms