Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms